Melatonin, memelilerde ve insanlarda beynin epifiz bezinden salgılanan bir hormondur.Çünkü melanin üreten hücreleri ışıklandırabildiği için epifiz hormonu, melatonin, melatonin olarak da bilinen melatonin ismi de buradan gelmektedir.Melatonin epifiz gövdesinde sentezlenip depolandıktan sonra sempatik sinir uyarımı, melatonin salgılaması için epifiz hücrelerini innerve eder.Melatonin salgılanmasının gündüzleri baskılanan ve geceleri aktif olan belirgin bir sirkadiyen ritmi vardır.Melatonin, hipotalamik-hipofiz-gonadal ekseni inhibe edebilir, gonadotropin salgılayan hormon, gonadotropin, luteinize edici hormon ve folikül uyarıcı hormonun içeriğini azaltabilir ve androjen, östrojen ve progesteron içeriğini azaltmak için doğrudan gonadlar üzerinde etkili olabilir.